近日,上海交通大学医学院分子医学研究院杨朝勇团队与附属仁济医院泌尿科郑军华团队在《自然通讯》(Nature Communications)上合作发表新研究。研究团队开发了一种名为 Dyna-vivo-seq 的创新技术,结合代谢标记与单细胞 RNA 测序,可在活体环境下精准追踪 RNA 的动态变化,为解析复杂疾病的分子机制提供全新手段。
利用 Dyna-vivo-seq,研究团队描绘了小鼠肾脏组织的 RNA 动态景观,发现不同细胞类型中 RNA 合成速率存在显著差异,例如 B 细胞的 RNA 新生比例最高。此外,在近曲小管细胞中识别出两类亚群,其 RNA 动态变化直接影响细胞的物质重吸收功能。这一发现为解析肾脏功能的细胞异质性提供了新视角。
更重要的是,研究团队通过肾脏缺血 - 再灌注损伤模型(IRI),揭示了急性肾损伤(AKI)早期基因表达的快速响应过程。缺氧阶段的转录因子(如 Jun 和 Fos)迅速上调,而再灌注阶段炎症相关因子(如 Cebpb)显著激活。相比传统 RNA 分析,基于新生 RNA 的分析表现出更高的灵敏度,能更早捕捉 AKI 过程中关键分子的变化,为早期干预提供了重要线索。
Dyna-vivo-seq 的开发为精准解析活体 RNA 动态提供了强大的工具,具有广泛的应用潜力。从急性损伤到慢性疾病,从基础研究到临床应用,这一技术为生物医学领域的深入探索打开了新的大门。
上海交通大学医学院附属仁济医院泌尿科郑军华教授、上海交通大学医学院分子医学研究院杨朝勇教授、上海交通大学医学院附属新华医院心血管发育与再生医学研究所副研究员宋佳和福建省能源材料科学与技术创新实验室副研究员林世超为该论文通讯作者。上海交通大学医学院分子医学研究院博士后尹坤、附属仁济医院泌尿科博士后郑重及厦门大学许依玲、郭烨为该论文第一作者。本研究得到国家自然科学基金项目的资助。
作者:唐闻佳
文:唐闻佳 图:受访方供图 编辑:唐闻佳 责任编辑:姜澎
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